至本精准病例夹
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——从精准诊疗视角剖析肿瘤病例!
导读
• 本案例记录了一名原发灶不明癌(CUP)患者,利用勤真 OrigiCUPAI精准预测了原发癌部位,辅助临床诊断,获得临床获益。
• 勤真 OrigiCUPAI是一款利用NGS技术和AI算法、提供对原发灶部位有效预测的工具,预测准确率高达83.2%,支持30种常见癌种,其独特算法已经获得了发明专利。
临床上大约有5%~10%的恶性肿瘤即使通过详细的病史、完善的辅助检查也不能确定原发位点,这些肿瘤称之为原发灶不明转移癌(CUP)[1] 。世界范围内,CUP位列最常见的十大癌症之一,死亡率排名第4位。在很长一段时间内,原发灶不明癌的治疗策略一直都是临床的难题。
至本医疗科技CEO王凯博士作为共同第一作者在《JAMA Oncology》发表了一项针对原发灶不明肿瘤的研究[2] ,通过对200名原发灶不明肿瘤(CUP)患者的基因测序结果进行分析,显示有85%(169/200)的CUP患者可以通过全面的基因检测找到可靶向的基因变异,而在原发灶不明的腺癌(ACUP)中有72%的患者存在临床上常见的络氨酸激酶(RTK)/RAS信号通路上的基因变异(如ALK, ARAF, BRAF, EGFR, FGFR1, FGFR2, KIT, KRAS, MAP2K1, MET, NF1, NF2, NRAS, RAF1, RET和 ROS1等)。
这一研究结果显示,绝大多数的CUP患者,都拥有至少一个临床有意义的基因变异,从而进行个体化治疗。
2020年,另一项日本的非随机临床试验,评估了 97 名未经治疗且经诊断后仍无法判断肿瘤原发灶的转移性癌症患者,对肿瘤样本进行 NGS 检测 ,利用算法根据基因表达和基因变异的数据来预测肿瘤原发灶,最终预测出 15 种不同类型的原发肿瘤,并根据基因结果对患者进行治疗,一年生存率达到 53 %,客观缓解率为 39 %。[3]
这意味着,利用高通量测序技术和卓越算法所获取的肿瘤基因变异数据,可以辅助诊断肿瘤的原发灶,指导临床精准诊疗。
2021年,至本医疗重磅推出的基于基因变异的CUP预测模型:勤真 OrigiCUPAI,采用 NGS+AI双重技术预测原发灶不明癌,基于至本累计的数万例中国人群肿瘤临床大数据,通过人工智能深度学习算法挖掘患者临床及基因检测数据中的信息,并将学习到的知识与患者肿瘤数据建立联系,以此总结推断其肿瘤类型或原发灶,以便辅助临床医生进行CUP的进一步鉴别诊断,帮助患者精准获益。目前,产品的CE认证、NMPA认证正在进行中。
患者年龄:76岁
患者性别:女性
入院检查:被诊断为淋巴结转移性肿瘤
病理诊断:(左侧锁骨上淋巴结)转移性癌,结合免疫组化结果,符合腺癌,部分为微乳头状腺癌,倾向于下消化道来源,请结合临床及相关检查进一步明确。
第一步:至本NGS大panel元溯检测显示,可能临床获益的药物6个,发现明确/潜在临床意义变异6个,意义不明变异10个。
第二步:基于送检样本的基因变异结果,进行勤真OrigiCUPAI原发灶不明癌的模型预测,预测可能性排序前三肿瘤类型为:
• 结直肠癌(预测可能性83.7%)
• 胃食道腺癌(预测可能性7.8%)
• 肺腺癌(预测可能性1.3%)
肿瘤类型预测的详细结果
基于病理、影像学检查、勤真 OrigiCUPAI预测结果,临床专家和患者最终选用了结直肠癌的治疗方案,并采用了奥沙利铂的化疗方案(《转移性结直肠癌维持治疗中国专家共识》指出卡培他滨单药或与奥沙利铂联合适用于转移性结直肠癌的一线治疗。),效果良好。
2021年,至本互联网医院重磅推出个体化智能电子报告,多维度、可视化、个性化展示报告内容,实时更新,让每一个患者可以在线检测病程、动态跟踪变化,并有机会选择获批药物和临床试验。
勤真 OrigiCUPAI产品优势
快速
基于NGS检测数据,最快1天可出具分析报告
精准
TOP5 总体平均准确率为 92.8%
全面
支持30种常见肿瘤预测分析
至本CUP AI算法优势
大样本
利用至本自有的数据库平台,在30个癌种超过数万例肿瘤患者的基础上,建立了基于基因突变的肿瘤类型预测,支持基因信息和临床信息的整合分析。与传统的免疫组织化学和临床评估相结合,可能提高诊断的准确性,具有重要的治疗意义。
多种突变类型
针对Panel、WES、WGS不同特征数据设计模型,将患者的年龄、性别、癌症分期等临床信息结合多种的突变类型数据作为输入进行预测,包括多种突变类型数据。结合特征工程的方式进行特征过滤、结合,最终构建出有效的患者信息输入给组合机器学习模型。
AutoML+独创No-Bias 算法
可自动预处理并清理数据,选择并构造合适的特征,以堆积木的方式从现有的几十个模型中选择合适的模型,并进一步优化模型超参数,严格分析模型输出结果。No-Bias 算法在癌种数据不均匀时可确保训练出来的模型能够“公正,无偏见”的输出预测结果。
专利AI模型
• 可以预测出常见癌症类型的概率,协助免疫组化结果;
• 使用更多的突变类型进行预测、包括DNA上的点突变、插入、缺失及融合等;
• 针对Panel、WES、WGS不同特征数据设计模型;
• 利用机器学习,输入特征丰富考虑范围广,同时数据的增加可以提高模型精度;
• 该模型适应于任何探针的数据进行构建模型。
• 目前,勤真 OrigiCUPAI已获得国家知识产权局授予的发明专利证书,至本医疗也成为首家拥有AI辅助诊疗CUP的精准医疗公司。
勤真 OrigiCUPAI适用患者
原发灶诊断不明的患者
有多种癌症病史的患者
有不典型的转移分布的患者
患者对治疗没有反应,怀疑诊断结果
无法明确病灶是原发性还是转移性的患者
勤真 OrigiCUPAI应用场景
确认原发灶不明癌
病理诊断存疑或不明时,可辅助病理诊断
有不典型的转移分布的患者
辅助精准诊疗 ,选择个体化治疗方案,提高患者获益
减少重复的实验室检测或活检
对于原发灶不明癌患者的诊疗主要是寻找原发病灶,并根据原发灶选择相应的治疗策略,但这一过程异常艰辛,很多患者因难以明确原发灶,而无法获得有效的治疗。
在AI技术的辅助下,肿瘤的原发灶能被更加广泛地确定,患者的预后也能被显著改善,是一个令人兴奋的消息。至本希望未来能利用高通量测序技术所获取的肿瘤变异数据,将AI模型应用在更多原发灶不明癌的诊断中,并参与临床试验,以确定它是否可以提高诊断能力和患者预后。
作为率先在国内完成CAP/CLIA“双C”认证、产品验证以及临床验证等全面体系建设的肿瘤精准医疗公司,至本医疗立足于患者获益需求,以领先的医学洞察、独创的生信算法和AI人工智能技术,始终致力于提升肿瘤患者的临床获益。
未来,至本医疗将继续推动检测技术、生信算法和AI人工智能技术的不断迭代和优化,持续助力肿瘤精准诊疗。每一次检测都能提供全面、准确的分子水平信息,不遗漏任何临床获益机会,至本检测“一次就够”!
参考文献:
1.洪亮, HONGLiang. 原发灶不明转移癌的临床诊断[J]. 国际肿瘤学杂志, 2008, 35(10):759-762.
2.Ross Jeffrey S,Wang Kai,Gay Laurie et al.Comprehensive Genomic Profiling of Carcinoma of Unknown Primary Site: NewRoutes to Targeted Therapies.[J] .JAMA Oncol, 2015, 1: 40-49.
3.Hidetoshi H. et al. JAMA Oncol. 2020; 6(12):1931-1938.